申请人向拟设立企业所在地的交通主管部门提交申请及有关资料——航管部门审核材料，并提出意见，按审批权限逐级上报——审批机关审核材料，对符合条件决定批准的，发给《筹建许可证》（或国内水路运输登记事项证明书），对不予批准的给予答复。

企业或业主提交申请及有关资料——航管部门审核材料，并提出意见，按审批权限逐级上报——审批机关审核材料，对符合条件决定批准的，发给《水路运输许可证》（或《船舶营业运输证》），对不予批准的给予答复。